(戒行清净)「他的第五大愿是：惟愿在遥远的未来世界，当我得以成就无上正等正觉智慧的时候，如果有那无量无边的有情众生，他们在我的正法中修习清净的法行，我一定使他们的戒行尽得圆满，没有一点残缺，通通都具有大乘菩萨所必须拥有的三聚戒：摄律仪戒、摄善法戒、饶益有情戒三种。假如有人违背了禁戒，毁坏了律条，只要能够听闻我的名号之后，就可以恢复清净，消除罪障，不会因为一时的毁犯戒律而再堕入三途恶趣。」

(诸根具足)「他的第六大愿是：惟愿在遥远的未来世界，当我得以成就无上正等正觉智慧的时候，假若一切有情众生之中，有人身体下劣，各种器官若有所残缺，诸如：相貌丑陋、形体蠢笨、顽固愚昧、眼瞎耳聋、声音嘶哑、哑巴、瘸手、驼背、痲疯、癫狂等等，以及有什么人受到任何疾病的痛苦折磨，只要他们听到我的名号，便会立即获得端正的形貌和清明的智慧，所有的器官、根性也都完好无缺，一切病痛霍然而除。」

(身心康乐)「他的第七大愿是：惟愿在遥远的未来世界，当我得以成就无上正等正觉智慧的时候，一切有情众生之中，如果有什么人受到诸多疾病的煎熬折磨，无人能够解救他的痛苦，又无所依托，没有医生可以看护，没有药物可以减除这种苦痛，没有亲戚、朋友、家眷的照料呵护，贫困无告，孤苦伶仃，处于这样的悲哀凄凉境地之中，只要他耳中一听到我药师佛的名号，则这须多无以名状的疾病痛楚都可以消除掉，而且能够得到身心安宁愉悦和快乐;一切赖以生存所需的资具，以及家庭眷属等亲情的慰藉，无不丰盈充足，了无缺憾，以至于因此而能够证得无上正等正觉的智慧。」

(转女成男)「他的第八大愿是：惟愿在遥远的未来世界，当我得以成就无上正等正觉智慧的时候，若有女人，为女身百恶所逼恼，而极其苦痛无法解脱，从而产生厌离女身的意念，希望舍弃女人之身，转为男身，她们只要听到了我的名号，立刻就可以转女成男，从此脱离女人的烦恼痛苦，并且具有端正威严的大丈夫相，乃至于因此而证得无上正等正觉的智慧。」

(回邪归正)「他的第九大愿是：惟愿在遥远的未来世界，当我得以成就无上正等正觉智慧的时候，让一切有情众生，都能够挣脱恶魔的所有罗网，不受一切歪道邪说的纠缠束缚。如果他们中间有人堕入了邪见恶解的荆棘葛藤所编织的密林，无法解脱迷茫的刺痛，我就会以我的方便威神力，引导他们，摄持护卫他们，使他们得以安立于正见之中，然后在逐渐地使他们修习四摄六度(布施、爱语、利行、同事)(布施、持戒、忍辱、精进、禅定、般若)的诸种菩萨道行，以使他们能够尽快地证得无上正等正觉的智慧。」